Giá trị của viên ngọc trai căn cứ vào nhiều yếu tố như: hình dáng, kích thước, màu sắc, độ dày lớp xà cừ, độ bóng, bề mặt (độ láng/tỳ vết). Viên ngọc trai đạt đầy đủ các yếu tố đó ở mức càng cao thì sẽ có giá trị viên ngọc sẽ càng lớn
Hình dáng: tròn đều có giá trị cao hơn hình giọt nước
Kích thước: kích thước lớn sẽ có giá trị cao hơn kích thước nhỏ
Màu sắc: màu hiếm, độc đáo có giá trị cao hơn màu sắc thông thường ( như Tahiti, Southsea)
Độ dày lớp xà cừ: xà cừ có độ dày càng cao thì giá trị càng lớn (chính vì vậy ngọc trai nuôi lâu năm sẽ có giá trị hơn)
Độ bóng: độ bóng càng cao ngọc càng có giá trị
Bề mặt (độ láng/ tỳ vết): ngọc càng ít tỳ vết giá trị càng cao